水質葉綠素研磨儀的應用主要是用于對植物樣品葉綠素A含量的提取測定。葉綠素通常存在于植物的葉子和綠莖中，不但是常見的天然色素之一，同時它也是植物光合作用所必需的催化劑；而葉綠素含量的多少也代表著該植物是否健康生長的標志之一。
作為一種天然食用色素，葉綠素不僅是食品中重要的添加劑，也是化妝品和制藥產品上的著色劑，它同時具有著一定的生物醫藥用途；另外葉綠素銅鈉鹽還可用于對食品飲料的加工；因此植物樣本葉綠素A的提取研究具有著重要意義。
取新鮮植物葉片在剪切后放轉離心管內，在管內加入一定量的二氧化硅和溶劑后，可將其樣本磨至糊狀，然后在離心管內加入剩余的溶劑，在具體實驗操作中可根據樣本量去進行添加；在提取樣本葉綠素的操作過程中需要加熱回流，在葉綠素物冷卻后，可在652nm為吸收峰測量其吸光度，反復三次，取其平均吸光度。通過實驗由此可見，在溶劑為乙醇時的樣本提取效率較高，但丙酮與乙醇的效果相差不大；由于丙酮的性價比，乙醇終被確定為葉綠素的提取溶劑。
葉綠素的提取時間和溫度與葉綠素的提取效率成正比，即時間越長，溫度越高，實驗效率越高。但提取時間若是過長不但會降低了效率，而且對葉綠素本身也有損失，因此操作時間不易過長。
因此在應用水質葉綠素研磨儀對植物樣本葉綠素A的提取操作中，由于葉綠素受熱易分解，因此不但需要選擇合適的時間，還要選擇適合的溫度，只有這樣才能夠滿足用戶對葉綠素的提取需求，且能夠較大限度的減少對樣本的損失。
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